MBD4

MBD4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MOE, 3IHO, 4DK9, 4E9E, 4E9F, 4E9G, 4E9H, 4EA4, 4EA5, 4LG7, 4OFA, 4OFE, 4OFH, 5CHZ
Ідентифікатори
Символи	MBD4, MED1, methyl-CpG binding domain 4, DNA glycosylase
Зовнішні ІД	OMIM: 603574 MGI: 1333850 HomoloGene: 2916 GeneCards: MBD4
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • satellite DNA binding • endodeoxyribonuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • hydrolase activity • pyrimidine-specific mismatch base pair DNA N-glycosylase activity • DNA N-glycosylase activity Клітинна компонента • Хроматин • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck Біологічний процес • response to estradiol • depyrimidination • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • response to radiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8930	17193
Ensembl	ENSG00000129071	ENSMUSG00000030322
UniProt	O95243	Q9Z2D7
RefSeq (мРНК)	NM_001276270 NM_001276271 NM_001276272 NM_001276273 NM_003925	NM_010774
RefSeq (білок)	NP_001263199 NP_001263200 NP_001263201 NP_001263202 NP_003916	NP_034904
Локус (UCSC)	Хр. 3: 129.43 – 129.44 Mb	Хр. 6: 115.82 – 115.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MBD4 (англ. Methyl-CpG binding domain 4, DNA glycosylase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 580 амінокислот, а молекулярна маса — 66 051.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGTTGLESLS		LGDRGAAPTV		TSSERLVPDP		PNDLRKEDVA		MELERVGEDE
EQMMIKRSSE		CNPLLQEPIA		SAQFGATAGT		ECRKSVPCGW		ERVVKQRLFG
KTAGRFDVYF		ISPQGLKFRS		KSSLANYLHK		NGETSLKPED		FDFTVLSKRG
IKSRYKDCSM		AALTSHLQNQ		SNNSNWNLRT		RSKCKKDVFM		PPSSSSELQE
SRGLSNFTST		HLLLKEDEGV		DDVNFRKVRK		PKGKVTILKG		IPIKKTKKGC
RKSCSGFVQS		DSKRESVCNK		ADAESEPVAQ		KSQLDRTVCI		SDAGACGETL
SVTSEENSLV		KKKERSLSSG		SNFCSEQKTS		GIINKFCSAK		DSEHNEKYED
TFLESEEIGT		KVEVVERKEH		LHTDILKRGS		EMDNNCSPTR		KDFTGEKIFQ
EDTIPRTQIE		RRKTSLYFSS		KYNKEALSPP		RRKAFKKWTP		PRSPFNLVQE
TLFHDPWKLL		IATIFLNRTS		GKMAIPVLWK		FLEKYPSAEV		ARTADWRDVS
ELLKPLGLYD		LRAKTIVKFS		DEYLTKQWKY		PIELHGIGKY		GNDSYRIFCV
NEWKQVHPED		HKLNKYHDWL		WENHEKLSLS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Hendrich B., Bird A. (1998). Identification and characterization of a family of mammalian methyl-CpG binding proteins. Mol. Cell. Biol. 18: 6538—6547. PMID 9774669 DOI:10.1128/MCB.18.11.6538
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Owen R.M., Baker R.D., Bader S., Dunlop M.G., Nicholl I.D. (2007). The identification of a novel alternatively spliced form of the MBD4 DNA glycosylase. Oncol. Rep. 17: 111—116. PMID 17143486

Див. також

• Хромосома 3