TNFRSF1B

TNFRSF1B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1CA9, 3ALQ
Ідентифікатори
Символи	TNFRSF1B, CD120b, TBPII, TNF-R-II, TNF-R75, TNFBR, TNFR1B, TNFR2, TNFR80, p75, p75TNFR, tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, TNF receptor superfamily member 1B
Зовнішні ІД	OMIM: 191191 MGI: 1314883 HomoloGene: 829 GeneCards: TNFRSF1B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • tumor necrosis factor-activated receptor activity • tumor necrosis factor binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • varicosity • extracellular region • аксон • soma • perinuclear region of cytoplasm • membrane raft • клітинне ядро • specific granule membrane • tumor necrosis factor receptor superfamily complex Біологічний процес • extrinsic apoptotic signaling pathway • RNA destabilization • cellular response to growth factor stimulus • positive regulation of membrane protein ectodomain proteolysis • GO:0010260 старіння людини • multicellular organism development • cell surface receptor signaling pathway • response to lipopolysaccharide • regulation of cell population proliferation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • apoptotic signaling pathway • inflammatory response • cellular response to lipopolysaccharide • negative regulation of inflammatory response • GO:0097285 апоптоз • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • neutrophil degranulation • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • cytokine-mediated signaling pathway • aortic valve development • pulmonary valve development • negative regulation of extracellular matrix constituent secretion • negative regulation of cardiac muscle hypertrophy • positive regulation of apoptotic process involved in morphogenesis • regulation of T cell cytokine production • regulation of myelination • regulation of T cell proliferation • regulation of neuroinflammatory response • cellular response to tumor necrosis factor • positive regulation of myelination • positive regulation of oligodendrocyte differentiation • negative regulation of cell death • negative regulation of neuroinflammatory response • glial cell-neuron signaling • negative regulation of neuron death • regulation of RNA biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7133	21938
Ensembl	ENSG00000028137	ENSMUSG00000028599
UniProt	P20333	P25119
RefSeq (мРНК)	NM_001066	NM_011610
RefSeq (білок)	NP_001057	NP_035740
Локус (UCSC)	Хр. 1: 12.17 – 12.21 Mb	Хр. 4: 144.94 – 144.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TNFRSF1B (англ. TNF receptor superfamily member 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 461 амінокислот, а молекулярна маса — 48 291.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPVAVWAAL		AVGLELWAAA		HALPAQVAFT		PYAPEPGSTC		RLREYYDQTA
QMCCSKCSPG		QHAKVFCTKT		SDTVCDSCED		STYTQLWNWV		PECLSCGSRC
SSDQVETQAC		TREQNRICTC		RPGWYCALSK		QEGCRLCAPL		RKCRPGFGVA
RPGTETSDVV		CKPCAPGTFS		NTTSSTDICR		PHQICNVVAI		PGNASMDAVC
TSTSPTRSMA		PGAVHLPQPV		STRSQHTQPT		PEPSTAPSTS		FLLPMGPSPP
AEGSTGDFAL		PVGLIVGVTA		LGLLIIGVVN		CVIMTQVKKK		PLCLQREAKV
PHLPADKARG		TQGPEQQHLL		ITAPSSSSSS		LESSASALDR		RAPTRNQPQA
PGVEASGAGE		ARASTGSSDS		SPGGHGTQVN		VTCIVNVCSS		SDHSSQCSSQ
ASSTMGDTDS		SPSESPKDEQ		VPFSKEECAF		RSQLETPETL		LGSTEEKPLP
LGVPDAGMKP		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tsuchiya N., Komata T., Matsushita M., Ohashi J., Tokunaga K. (2000). New single nucleotide polymorphisms in the coding region of human TNFR2: association with systemic lupus erythematosus. Genes Immun. 1: 501—503. PMID 11197692 DOI:10.1038/sj.gene.6363700
• Rothe M., Wong S.C., Henzel W.J., Goeddel D.V. (1994). A novel family of putative signal transducers associated with the cytoplasmic domain of the 75 kDa tumor necrosis factor receptor. Cell. 78: 681—692. PMID 8069916 DOI:10.1016/0092-8674(94)90532-0
• Park Y.C., Burkitt V., Villa A.R., Tong L., Wu H. (1999). Structural basis for self-association and receptor recognition of human TRAF2. Nature. 398: 533—538. PMID 10206649 DOI:10.1038/19110
• Peral B., San Millan J.L., Castello R., Moghetti P., Escobar-Morreale H.F. (2002). Comment: the methionine 196 arginine polymorphism in exon 6 of the TNF receptor 2 gene (TNFRSF1B) is associated with the polycystic ovary syndrome and hyperandrogenism. J. Clin. Endocrinol. Metab. 87: 3977—3983. PMID 12161545 DOI:10.1210/jcem.87.8.8715
• Engelmann H., Novick D., Wallach D. (1990). Two tumor necrosis factor-binding proteins purified from human urine. Evidence for immunological cross-reactivity with cell surface tumor necrosis factor receptors. J. Biol. Chem. 265: 1531—1536. PMID 2153136

Див. також

• Хромосома 1