KEGG

KEGG (Kjoto enciklopedija gena i genoma) je kolekcija onlajn baza podataka koje obuhvataju oblasti genoma, enzimatskih puteva, i bioloških jedinjenja. PATHWAY baza podataka sadrži mrežu molekulskih interakcija u ćelijama, i njihovih varijanti u specifičnim organizmima.

Istorija

Japanski program za ljudski genom je osnovao KEGG, Kjoto enciklopediju gena i genoma, 1995. godine^[1]. Njeni osnivači smatraju KEGG "računarskom reprezentacijom" biološkog sistema^[2]. KEGG nalazi primenu u modelovanju i simulacijama, kao i u pregledu i pretraživanju podataka. On je komponenta sistemsko biološkog pristupa.

KEGG sadrži pet glavnih baza podataka:^[3]

KEGG Atlas
KEGG Put
KEGG Geni
KEGG Ligand
KEGG BRITE

Vidi još

Literatura

^ Kanehisa M (1997). „A database for post-genome analysis.”. Trends Genet. 13 (9): 375—6. PMID 9287494.
^ Kanehisa M; Goto S; Hattori M; Aoki-Kinoshita KF; Itoh M; Kawashima S; et al. (2006). „From genomics to chemical genomics: new developments in KEGG.”. Nucleic Acids Res. 34 (Database issue): D354—7. PMC 1347464  . PMID 16381885. doi:10.1093/nar/gkj102.
^ Kanehisa M, Goto S, Kawashima S, Okuno Y, Hattori M (2004). „The KEGG resource for deciphering the genome.”. Nucleic Acids Res. 32 (Database issue): D277—80. PMC 308797  . PMID 14681412. doi:10.1093/nar/gkh063.

Spoljašnje veze

[pmid9287494-1] Kanehisa M (1997). „A database for post-genome analysis.”. Trends Genet. 13 (9): 375—6. PMID 9287494.

[pmid16381885-2] Kanehisa M; Goto S; Hattori M; Aoki-Kinoshita KF; Itoh M; Kawashima S; et al. (2006). „From genomics to chemical genomics: new developments in KEGG.”. Nucleic Acids Res. 34 (Database issue): D354—7. PMC 1347464  . PMID 16381885. doi:10.1093/nar/gkj102.

[pmid14681412-3] Kanehisa M, Goto S, Kawashima S, Okuno Y, Hattori M (2004). „The KEGG resource for deciphering the genome.”. Nucleic Acids Res. 32 (Database issue): D277—80. PMC 308797  . PMID 14681412. doi:10.1093/nar/gkh063.

[1]

[2]

[3]