HIST1H2AM

HIST1H2AM
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4QYL, 5KGF
Ідентифікатори
Символи	H2AC17, H2A.1, H2A/n, H2AFN, dJ193B12.1, histone cluster 1, H2am, histone cluster 1 H2A family member m, H2A clustered histone 17, HIST1H2AM, H2AC11, H2AC15, H2AC16, H2AC13
Зовнішні ІД	OMIM: 602796 MGI: 2448289 HomoloGene: 136769 GeneCards: H2AC17
Онтологія гена Молекулярна функція • enzyme binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity Клітинна компонента • Нуклеосома • екзосома • клітинне ядро • хромосома Біологічний процес • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8336	319165
Ensembl	ENSG00000278677	ENSMUSG00000071478
UniProt	P0C0S8	C0HKE2 B2RVF0 C0HKE1 C0HKE3 C0HKE5 C0HKE4 C0HKE6 C0HKE7 C0HKE8 C0HKE9
RefSeq (мРНК)	NM_003514	NM_178188
RefSeq (білок)	NP_066408 NP_003505	NP_835496 NP_835495 NP_835494 NP_835491 NP_835489 NP_783591 NP_835493 NP_835496 NP_835489 NP_835495 NP_835494 NP_835491 NP_835492 NP_783591 NP_001171015 NP_835489 NP_001171015 NP_835496 NP_835491 NP_835493 NP_835494 NP_835495 NP_835492 NP_783591 NP_835495 NP_835489 NP_835494 NP_835491 NP_835492 NP_783591 NP_001171015 NP_835493 NP_835496 NP_835494 NP_835489 NP_835495 NP_835491 NP_835492 NP_783591 NP_001171015 NP_835493 NP_835496 NP_835492 NP_835491 NP_835489 NP_835495 NP_835494 NP_783591 NP_001171015 NP_835493 NP_835496 NP_835491 NP_835489 NP_835495 NP_835494 NP_835492 NP_783591 NP_001171015 NP_835493 NP_835496 NP_783591 NP_835489 NP_835495 NP_835494 NP_835491 NP_835492 NP_001171015 NP_835493 NP_835496 NP_783591 NP_835489 NP_835495 NP_835494 NP_835491 NP_835492 NP_001171015 NP_835493 NP_835496
Локус (UCSC)	Хр. 6: 27.89 – 27.89 Mb	Хр. 13: 23.76 – 23.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HIST1H2AM (англ. Histone cluster 1 H2A family member k) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 130 амінокислот, а молекулярна маса — 14 091.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGRGKQGGK		ARAKAKTRSS		RAGLQFPVGR		VHRLLRKGNY		AERVGAGAPV
YLAAVLEYLT		AEILELAGNA		ARDNKKTRII		PRHLQLAIRN		DEELNKLLGK
VTIAQGGVLP		NIQAVLLPKK		TESHHKAKGK

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Albig W., Doenecke D. (1997). The human histone gene cluster at the D6S105 locus. Hum. Genet. 101: 284—294. PMID 9439656 DOI:10.1007/s004390050630
• Albig W., Trappe R., Kardalinou E., Eick S., Doenecke D. (1999). The human H2A and H2B histone gene complement. Biol. Chem. 380: 7—18. PMID 10064132 DOI:10.1515/BC.1999.002
• Dobner T., Wolf I., Mai B., Lipp M. (1991). A novel divergently transcribed human histone H2A/H2B gene pair. DNA Seq. 1: 409—413. PMID 1768865 DOI:10.3109/10425179109020799
• Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes. Genomics. 80: 487—498. PMID 12408966 DOI:10.1006/geno.2002.6850
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Galasinski S.C., Louie D.F., Gloor K.K., Resing K.A., Ahn N.G. (2002). Global regulation of post-translational modifications on core histones. J. Biol. Chem. 277: 2579—2588. PMID 11709551 DOI:10.1074/jbc.M107894200

Див. також

• Хромосома 6